關(guān)鍵字:智能手機(jī)顯微鏡 醫(yī)療診斷 掃描DNA 電子實(shí)驗(yàn)室模塊
這款智能手機(jī)的附件包括一個(gè)外部透鏡、薄膜干涉濾光器、可微調(diào)的微型楔形榫頭支架,以及雷射二極管,全部封裝在一個(gè)以3D打印的小型方盒中,并整合成一款手持式熒光顯微鏡。
“DNA單分子在拉長(zhǎng)時(shí)的寬度約2nm,”UCLA霍華德.休斯醫(yī)學(xué)院(HHMI)教授A(yíng)ydogan Ozcan表示,“以透視來(lái)看,它使DNA較人的發(fā)絲還細(xì)約50,000倍。目前,為單個(gè)DNA分子進(jìn)行成像需要昂貴又龐大的光學(xué)顯微鏡工具,使其幾乎僅限于先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)室設(shè)置才能進(jìn)行。相形之下,這款適用于個(gè)人手機(jī)的附件設(shè)備顯然就沒(méi)那么昂貴了。”
雖然其他“智能手機(jī)變身顯微鏡”的設(shè)備也能夠成像出較大規(guī)模的對(duì)象,例如細(xì)胞;但是,Ozcan的研究團(tuán)隊(duì)最新開(kāi)發(fā)出的這款智能手機(jī)光學(xué)附件,則是首款可成像DNA單分子纖薄鏈以及調(diào)整其大小的設(shè)備。
該設(shè)備主要用于遠(yuǎn)程的實(shí)驗(yàn)室設(shè)置,以診斷不同類(lèi)型的癌癥與神經(jīng)系統(tǒng)疾病,例如阿爾茲海默癥(Alzheimer),以及偵測(cè)傳染病的抗藥性。為了利用手機(jī)上的相機(jī),首先必須以熒光標(biāo)記隔絕以及標(biāo)示所需的DNA。Ozcan表示,如今,這種實(shí)驗(yàn)室程序已經(jīng)能在偏遠(yuǎn)地區(qū)以及資源有限的環(huán)境下進(jìn)行了。
為了掃描DNA,研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)出可執(zhí)行在同一支智能手機(jī)上的運(yùn)算接口,以及一款Windows智能應(yīng)用程序。掃描后的信息可被傳送至遠(yuǎn)程O(píng)zcan實(shí)驗(yàn)室中的服務(wù)器,然后測(cè)量DNA分子長(zhǎng)度。在聯(lián)機(jī)可靠可情況下,完整的數(shù)據(jù)處理過(guò)程只需要10秒鐘的時(shí)間。
圖中顯示智能手機(jī)安裝該成像設(shè)備與用戶(hù)接口,并以25美分硬幣作為對(duì)比。(來(lái)源:UCLA)
在Ozcan的實(shí)驗(yàn)室中,研究人員們成像熒光標(biāo)記與拉伸DNA節(jié)段,為該設(shè)備的準(zhǔn)確度進(jìn)行測(cè)試。結(jié)果發(fā)現(xiàn)它能夠可靠地倍增10,000個(gè)堿基對(duì)或更長(zhǎng)的DNA節(jié)段(堿基對(duì)是構(gòu)成DNA的基本結(jié)構(gòu)單元)。許多重要的基因都落在這個(gè)大小范圍,包括為金黃色葡萄球菌與其他細(xì)菌提供抗生素抗藥性的細(xì)菌基因 ,大約有14,000個(gè)堿基對(duì)長(zhǎng)。
然而,由于較短節(jié)段時(shí)的訊噪比(SNR)偵測(cè)減少以及明顯差異,智能手機(jī)顯微鏡在5,000或更短堿基對(duì)節(jié)段時(shí)的準(zhǔn)確度急速下降。這時(shí),必須將該設(shè)備的現(xiàn)有透鏡置換成更高數(shù)倍數(shù),就可以輕易地解決這個(gè)問(wèn)題。
除了用于定點(diǎn)照護(hù)診斷,Ozcan建議該平臺(tái)也可用于區(qū)別高分子量的DNA節(jié)段,從而有助于解決使用傳統(tǒng)凝膠電泳的問(wèn)題——在生物化學(xué)和分子生物學(xué)中,這種凝膠電泳經(jīng)常用來(lái)擴(kuò)展DNA與RNA節(jié)段。接下來(lái),Ozcan及其研究團(tuán)隊(duì)計(jì)劃測(cè)試該領(lǐng)域的其他組件,進(jìn)一步偵測(cè)與瘧疾有關(guān)的抗藥性。
延伸閱讀:蘋(píng)果開(kāi)發(fā)應(yīng)用收集用戶(hù)DNA數(shù)據(jù)
《麻省理工科技評(píng)論》報(bào)道稱(chēng),蘋(píng)果正在與美國(guó)多家研究機(jī)構(gòu)合作開(kāi)發(fā)應(yīng)用,收集并整理用戶(hù)的基因數(shù)據(jù)。
報(bào)道援引消息人士的說(shuō)法稱(chēng),這些應(yīng)用將“向一些iPhone用戶(hù)提供機(jī)會(huì),幫助他們進(jìn)行基因檢測(cè)”。其中,許多人將是首次進(jìn)行基因檢測(cè)。
這些新應(yīng)用將基于蘋(píng)果的ResearchKit。這一數(shù)據(jù)整合平臺(tái)可以收集來(lái)自用戶(hù)設(shè)備的信息,將信息進(jìn)行打包用于醫(yī)學(xué)研究。醫(yī)院和其他研究人員可以連接至ResearchKit平臺(tái),從而迅速獲得大量的研究樣本。
蘋(píng)果目前已發(fā)布了一些基于ResearchKit的應(yīng)用。在幾天之內(nèi),這些應(yīng)用就吸引了數(shù)千用戶(hù)。
蘋(píng)果的下一步計(jì)劃是收集用戶(hù)的基因數(shù)據(jù)。不過(guò),由于首先需要通過(guò)生物樣本去創(chuàng)建基因數(shù)據(jù),因此蘋(píng)果將要求應(yīng)用用戶(hù)提供唾液樣本。這些樣本不會(huì)被送往蘋(píng)果,而是被送往加州大學(xué)舊金山分校或紐約西奈山醫(yī)院的基因測(cè)序中心。研究人員將在ResearchKit的云計(jì)算平臺(tái)中保存這些數(shù)據(jù),其中一些信息將直接出現(xiàn)在用戶(hù)的iPhone中。
在基因研究領(lǐng)域,蘋(píng)果和研究合作伙伴需要非常謹(jǐn)慎,避免獲取及展示基因信息的過(guò)程被視為一種“診斷”。2013年,基因科技公司23andMe由于這樣的問(wèn)題遭到了美國(guó)食品藥品管理局的禁令。
蘋(píng)果尚未對(duì)此消息做出回應(yīng)。